공간 전사체학을 활용한 단일세포 수준의 세포 유형별 단백질-핵산 상호작용(PNA) 프로파일링

공간 전사체학은 조직 내 특정 위치에 존재하는 유전체 정보를 제공하며, 이를 확장하여 단일세포 수준에서 발생하는 복잡한 단백질-핵산 상호작용(PNA)을 추적하는 기술적 프레임워크입니다.

분석 방법론

• 인터랙톰 매핑: 공간적으로 해상도 높은 전사체 데이터 위에 특이적인 Probe 또는 형광 보고자를 사용하여 특정 RNA 결합 단백질(RBP)과 표적 mRNA 사이의 3차원적 거리를 측정합니다.
• 다중 오믹스 통합: 초기 단일세포 분석 결과와 결합하여, 해당 공간 좌표상의 세포 집단에서 우세한 전사체 상태와 특정 PNA 패턴을 연관 짓습니다.

이러한 방법을 통해 기존의 Bulk Assay로는 얻을 수 없는, 조직 내 미세 환경(Microenvironment)에 따른 세포 특이적인 유전자 조절 기전을 밝혀낼 수 있습니다. 오믹스 통합 분석, 시스템 생물학적 관점의 접근이 필수적입니다.