공간 전사체학 데이터의 다층적 통합 분석을 통한 세포 간 신호 전달 경로 재구성 방법론

공간 전사체학 데이터는 조직 내 세포 유형별 유전자 발현 패턴을 공간적으로 매핑하며, 이를 다양한 오믹스 데이터와 통합하여 세포 간 신호 전달 네트워크를 추론하는 데 활용됩니다.

통합 분석 워크플로우

• 패턴 정렬 및 필터링: 공간 전사체학 결과와 단일세포 분석 데이터를 정렬하여 관심 있는 세포 유형 클러스터를 추출합니다.
• 상호작용 매핑: 리셉터-리간드 쌍 정보를 포함한 외부 데이터를 이용하여 공간적으로 인접한 세포들 간의 잠재적 신호전달 경로를 모델링합니다.
• 통계적 정규화 및 추론: 바이오빅데이터 처리 기법(예: 그래프 기반 모델링)을 적용하여 노이즈를 최소화하고 가장 가능성 높은 세포 간 통신 모듈을 도출합니다.

이러한 통합적 접근은 단순히 유전자 발현량을 확인하는 것을 넘어, 실제 생체 환경 내에서 발생하는 동적인 세포 미세환경 상호작용을 이해하는 데 핵심적인 역할을 합니다. 시스템 생물학, 공간 전사체학, 오믹스 통합 분석