역분화 줄기세포의 후성유전체 재설정 과정을 추적하는 공간 전사체학적 접근법

역분화 줄기세포(iPSC) 제작 시 발생하는 세포 운명의 급격한 재프로그래밍 과정에서 나타나는 후성유전학적 변화의 공간적 패턴을 규명하기 위해 공간 전사체학 기술이 활용됩니다.

방법론적 적용

• mRNA 및 3D 구조 매핑: iPSC 유도 전/후의 세포 내 특정 유전자들의 발현 수준 변화를 세포의 원래 위치 정보를 유지하며 측정합니다.
• 후성유전체 연관 분석: 공간적으로 얻어진 전사체학 데이터와 DNA 메틸화 또는 히스톤 변형 프로파일을 통합하여, 어떤 유전자 조절 네트워크가 시간 및 공간에 따라 재구성되는지를 추적합니다.

이를 통해 단순히 평균적인 유전자 발현 변화를 넘어, 세포 집단 내에서 발생하는 이질적(heterogeneous) 재프로그래밍 경로와 관련된 유전자 발현 조절 기전을 심층적으로 이해할 수 있습니다. 이는 궁극적으로 재생의학 분야에서의 세포 치료제 개발 방향을 제시합니다.